Detašované pracoviště MBÚ – Cenrum Algatech v Třeboni patří k předním světovým pracovištím věnující se základnímu a aplikovanému výzkumu fototrofních mikroorganismů. Centrum Algatech je vedoucím partnerem celého projektu. Laboratoř fotosyntézy se podílí na konstrukci nového typu produkční buňky (cell factory) pro biotechnologické aplikace a konstrukci syntetických světlosběrných antén pro sinicovou buňku, vývojem plazmidu s regulovatelným počtem kopií a hledáním nových biosyntetických drah a enzymů. Laboratoř řasové biotechnologie se zaměřuje na identifikování nových sekundárních metabolitů sinic pro farmakologii a testování jejich produkce ve zkušebním provozu. Laboratoř buněčných cyklů řas identifikuje mechanismy, které kontrolují produkci zásobních látek na úrovni koordinace procesů mezi jádrem a chloroplastem. Laboratoř anoxygenních fototrofů identifikuje biotechnologicky relevantní geny a celé biosyntetické dráhy v genomech fototrofních bakterií.
Laboratoř charakterizace molekulárních struktur v projektu využije nukleární magnetickou rezonanci ke sledování značených metabolitů. Pomocí NMR řešeny struktury nízkomolekulárních bioaktivních látek.
V detašovaném pracoviště MBÚ na zámku Nové Hrady (30 km jižně od Třeboně) bude umístěn počítačový klastr.
Dalším místem realizace projektu je MBÚ – Centrum BIOCEV ve Vestci u Prahy, Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace. Toto pracoviště je zaměřeno na nejmodernější techniky hmotnostní spektrometrie v oblastech proteomiky, strukturní biologie a biomedicíny. Laboratoř vyvíjí nová chemická činidla pro cross-link proteinových komplexů a nové techniky povrchového značení proteinů pro obtížně řešitelné proteinové komplexy, např. membránové proteiny. Skupina se bude podílet na obou výzkumných záměrech v rámci kterých bude řešit interakci mezi proteiny včetně membránových proteinových komplexů, posttranslační modifikace a stanovením metabolických toků v buňce.
Laboratoř se zaměřuje na studium excitovaných stavů fotosyntetických pigmentů a pigment-proteinových komplexů zodpovědných za absorbci fotonů a za procesy přenosu energie a elektronů ve fotosyntéze. Laboratoř vyvíjí ultrarychlé (fs) časově rozlišené (time-resolved) techniky k pochopení dynamických procesů na úrovni jednotlivých molekul. Jejím cílem je analyzovat pigmenty a pigment-proteinové komplexy pomocí časově rozlišené spektroskopie a charakterizovat účinnost různých fotosyntetických procesů, jako je záchyt světla, přenos energie a její zhášení.
Skupina aplikované a integrované fotoniky Oddělení mikrofotoniky navrhuje a vyrábí speciální optické prvky pro pokročilé spektrální, hyperspektrální a Ramanovy zobrazovací systémy. Skupina vyvíjí a integruje Ramanovský a epi-fluorescenční detektor do automatizovaného a high-throughput screeningového systému.
Parazitologický ústav studuje diverzitu, ekologické role a metabolický potenciál významných či zajímavých jednobuněčných eukaryotů. Toto pracoviště se zaměří na hledání nových eukaryotních metabolických drah.
Ústav molekulární biologie rostlin provádí komplexní výzkum rostlin na molekulární úrovni – studium rostlinných genomů, struktury a funkce buněk, rostlinných metabolitů, molekulárních principů fotosyntézy, biofyzikálních a biochemických procesů v rostlinách. Laboratoř epigenetiky rostlin se zabývá epigenetickými mechanismy, které jsou základem reakcí rostlin na podmínky prostředí. Tato skupina bude řešit úlohu TOR (target of rapamycin) signalizace a epigenetického přeprogramování buněčného jádra u rostlin.
Výzkumné zaměření Katedry biofyziky Přírodovědecké fakulty spočívá ve studiu biofyzikálních aspektů fyziologie rostlin a stresu rostlin, produkce reaktivních forem kyslíku v biologických systémech, strukturních a funkčních vlastností proteinů a nukleových kyselin a molekulární a buněčné farmakologie. Skupina Romana Kouřila, v rámci Katedry biofyziky, se zaměří především na charakterizaci fotosyntetických membránových proteinových komplexů a superkomplexů a jejich meziproduktů s důrazem na detailní určení jejich struktury pomocí elektronové mikroskopie (EM) včetně jednočásticové Cryo-EM.
